下级生第二季全集动画故事主要是环绕原创人物岸田瞬与各个女主角交织的故事为中心。这个人物有太多不明之处并且有点故弄玄虚，而结局亦没有表明他的真实身份为何，就此留下成堆谜题为结局。但根据动画的最后两话可以猜出岸田瞬可能是幽灵。别的，彻底没有阐明故事的舞台及背景，因而引起观众之间的批评。