《特搜9》讲述了原警视厅搜查一课9系加纳课长离开后，队伍解散，警视厅成立新的特别搜查班，九系成员重聚，浅轮直树等刑警在新班长宗方朔太郎带领下，继续调查疑难案件的故事。 《特捜9》中，新人刑警新藤亮将与原九系活跃的成员合作，共同展开调查。新藤亮由山田裕贵饰演，从第一集登场。在调入特搜班之前，浅轮刑警在追查犯人时遇到新藤，新藤要如何加入特搜班，九系最年轻的直树如何对待第一位“后辈刑警”，如何展开搜查，这些都将在新篇中展现。